Density Functional (DFT) Methods
Basis Sets
Hybrid Functionals:Becke Three-Parameter Hybrid Functionals、 Functionals Including Dispersion、 Other Hybrid Functionals、 User-Defined Hybrid Models
Pure Functionals: Exchange Functionals、 Correlation Functionals、 Standalone Pure Functionals、
注意研究体系通常涵盖硅酸盐、玻璃、陶瓷、熔渣、熔体、熔盐、界面等等,检索方法类文献时注意切换不同关键词进行检索,比如cp2k中的很多论文是基于高被引方法检索melt体系查找到的。
Quantum Chemical Calculations
Gaussian泛函和基组
1991年日本京都大学的Takashi Uchino000采用Gaussian82研究了H6-xSi2O7Nax (x= 0,1,2,and 4)钠硅酸盐团簇,几何优化在HF/STO-3G水平上进行,单点能计算使用价层分裂基组,3-21G和3-21G+d极化函数,论文发表在JPC上:Ab initio molecular orbital calculations on the electronic structure of sodium silicate glasses。
1992年日本京都大学的Takashi Uchino等人000研究了网络改性剂阳离子类型对碱金属硅酸盐玻璃结构的改变,论文发表在J. Phys. Chem.上。
1993年日本京都大学的Takashi Uchino等人000研究了钠铝硅酸盐玻璃的局部结构,论文发表在J. Phys. Chem.上。
1998年日本京都大学的Takashi Uchino等人000采用Gaussian计算了五个SiO3/2O-Na+团簇的结构和振动特性,在Hartree-Fock/6-31G(d)水平进行几何优化,论文发表在JPCB上。
1999年日本京都大学的Takashi Uchino等人000通过在Hartree-Fock/6-31G(d) 水平上使用簇模型研究了单碱和混合碱硅酸盐玻璃中碱性阳离子(Li+和 Na+)的局部配位环境。
2001年美国斯坦福大学的Sung Keun Lee团队007基Gaussian 98进行量子化学计算和17O 和11B NMR研究二元硼硅酸盐玻璃的拓扑无序和反应性,[4]Si-O-[3]B ([4]Si-O-[4]Si, [4]Si-O-[3]B,和[3]B−O−[3]B) 的稳定性是根据桥接氧簇之间的相对能量差异来评估的,在B3LYP/6-311+G(2d,p)//HF/3-21G 和 B3LYP/6-311+G(2d,p) 理论水平计算,论文发表在JPCB上。除了桥接氧之外的所有氧都以氢终止以进行电荷平衡,可以观察到B的四配位氧中除了桥连氧,剩余的非桥氧也是用氢来终止的。该论文的背景是水性流体对硼硅酸盐玻璃的腐蚀已成为其用于核废料封存的重要问题。玻璃表面和水溶液接触的宏观反应性以及体相材料的性质明确地与无序程度相关,因为玻璃的动力学稳定性受不同氧簇的反应性(由水解焓表示)的影响 、它们的化学短程有序 (CSRO) 以及它们相对于键角 (TSRO) 的稳定性变化。论文中作者基于不同泛函和基组分别对构型进行优化和单点能计算,a,B3LYP/6-311G(d)//HF/6-311G(d);b,B3LYP/6-311+G(2d,p)//HF/3-21G;c,B3LYP/6-311G(d)//HF/3-21G,;一些构型几何优化是通过 2).d,B3LYP/6-311+G(2d,p)// B3LYP/6-311+G(2d,p);e,B3LYP/6-311+G(2d,p)// HF/6-311G(d)来完成的。计算中的约束条件是氢-氧键长度和包含氢的角度(H-O-Si 和 H-O-B) 对于每个四面体都是相同的,以减少氢-氧键角和长度对单点能量计算的影响。论文中部分几何优化使用的是HF方法,但单点能计算使用的是B3LYP方法,因为HF方法没有包含电子相关效应,计算单点能是不准确的。
2003年美国华盛顿卡内基研究所地球物理实验室的Sung Keun Lee团队000结合核磁共振和量子化学计算研究了10GPa压力条件下钠硅酸盐玻璃和熔体中的有序和无序,论文发表在Geophysical Research Letters。论文中提出高压下形成了[5,6]Si-O-[4]Si 和 Na-O-[5,6]Si的高配位桥氧和非桥氧位点,模拟的团簇体系为(NaSi5O5(OH)11),所有的非桥氧用H原子来补偿电荷,团簇中创新性地考虑了碱金属阳离子,并提出 Na 作为[5]Si周围的电荷平衡阳离子。
2004年美国华盛顿卡内基研究所地球物理实验室Sung Keun Lee008基于Gaussian98软件包,B3LYP/6-311+G(2d,p)泛函基组进行量子化学计算和固态核磁共振研究了高压下硅酸盐玻璃和熔体的结构,论文发表在JPCB上。优化是在HF/6-311G(d)水平下进行的,论文题目为Structure of Silicate Glasses and Melts at High Pressure: Quantum Chemical Calculations and Solid-State NMR。
2006年首尔国立大学Sung Keun Lee团队000基于O-17 NMR 结果和量子化学分子轨道计算研究了硅酸钙和铝硅酸盐玻璃中的无序和聚合程度,基于Gaussian98,HF,B3LYP,6-311G(2d,p),研究了CaAl2Si1O2(OH)8团簇。
2006年首尔国立大学Sung Keun Lee团队000基于Gaussian98, B3LYP, 6-311G(2d,p)基组,进行GeO2和Na锗酸盐玻璃中锗酸盐异常的原子成因:从二维17O核磁共振和量子化学计算中的启示,论文发表在JPCB期刊上。
2007年美国西北太平洋国家实验室Karen L. Schuchardt等人000在Journal of Chemical Information and Modeling发表论文:Basis Set Exchange: A Community Database for Computational Sciences,建立了最重要、最全面的基组+赝势数据库,已把绝大多数(特别是常用的)目前已经发表的基组和赝势都已经纳入进去了,并且不断更新,已经成为搞量化的人必不可少的网站。输出格式支持很多程序。但注意极个别元素的个别不常用的基组的定义可能有误,所以如果得到奇怪结果别忘了检查下拷来的基组定义是否合理。据说此基组库以后会把旋轨势也加进去。
2007年奥地利Joachim Paier等人004讨论了为什么B3LYP泛函对于优化金属晶格参数失效,论文发表在The Journal of Chemical Physics。
2007年韩国首尔国立大学的Insung Lee团队000基于Gaussian98,B3LYP/6-311+G(d,p),进行了成矿流体中平衡铜 (I) 同位素分馏的量子化学计算,论文发表在Chemical Geology期刊上。
2007年美国Thomas G. Spiro团队000基于Gaussian03, B3LYP泛函,LANL2DZ ECP和 6-31+G(2df,p)基组进行钼同位素分馏的密度泛函理论分析,论文发表在JPCA期刊上。
2008年Marta Corno等人000基于分子模拟和使用B3LYP泛函的量子力学计算进行了45S5生物活性玻璃全振动谱的模拟。
2008年葡萄牙的José R.B.Gomes等人000使用Gaussian03研究了由多达五个硅原子组成的线性、支化和环状硅酸盐的气相稳定性。 起始几何形状是从经典分子动力学模拟中获得的,在B3LYP/6-31G(d)水平优化,在B3LYP/6-311+G(2d,2p)理论水平进行计算,论文发表在Geochimica et Cosmochimica Acta。
2009年日本的Kazuki MORITA000团队采用Gaussian03计算了熔渣中的B,论文发表在ISIJ上,Behavior and State of Boron in CaO–SiO2 Slags during Refining of Solar Grade Silicon。
2009年意大利的Alfonso Pedone团队000基于Crystal 06软件包进行了磷硅酸盐玻璃的振动特征:周期性 B3LYP 模拟的量子化学研究,论文发表在Chemical Physics Letters期刊上。
2010年德国的Stefan Grimme等人000在JCP上发表论文:A consistent and accurate ab initio parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu,提出DFT-D3色散校正。
2010年日本京都大学的Toshiyuki Fujii团队000基于Gaussian03, B3LYP, 6-311+G**
、 LanL2DZ等基组泛函计算了水性Zn(II) 物质的轨道几何形状和振动频率,论文题目为:水、氯和大环配合物之间锌同位素分馏的实验和理论研究,论文发表在JPCA期刊上。
2010年韩国首尔国立大学Sung Keun Lee团队000基于B3LYP/6-311+G(2d,p)泛函基组进行了硼锗酸盐玻璃中化学和拓扑紊乱的性质:B-11 和 O-17 固态核磁共振和量子化学计算的见解,论文发表在JPCB期刊上。
2011年德国的Stefan Grimme000在Computational Molecular Science上发表综述“Density functional theory with London dispersion corrections”,对于色散作用本质没写清楚,分析目前DFT泛函对弱相互作用之差的原因倒是挺明白,很自然地引出了要进行校正的必要。谈了四种将色散校正纳入泛函的做法,进行了比较,写得不错,着重说了DFT-D的巨大好处。然后简要比较了下各种泛函的性能,不过不很系统。
2011年德国的Stefan Grimme团队000在PPCP上发表论文“A thorough benchmark of density functional methods for general main group thermochemistry, kinetics, and noncovalent interactions”,文中用GMTKN30测试集(含30个子集,原子化能、反应热、势垒、弱相互作用等等体系大全),号称是thorough比较泛函的性能。
2011年日本京都大学的Toshiyuki Fujii团队000基于Gaussian 03, 6-311+G(d,p)基组,进行了现代和古代海洋相关物种中镍同位素分馏的理论和实验研究,论文发表在Geochimica et Cosmochimica Acta期刊上。
2011年北京科技大学的卢天等人000发表论文分子轨道成分的计算,对分子轨道中基函数的成分、原子轨道的成分以及原子的成分这些基本概念和计算方法进行了详细讨论,通过实例分析比较了不同方法间的差异,同时指出了计算和分析时需要注意的问题,给出了在方法选择上的建议.
2011年北京科技大学的卢天等人000介绍了电子局域化的概念,并从电子对密度和动能密度两个角度详细讨论了ELF的物理意义和功能形式之间的重叠。论文发表在 Acta Physico-Chimica Sinica期刊上。
2013年北科大的Tian Lu001在Journal of Molecular Modeling发表论文:Revealing the nature of intermolecular interaction and configurational preference of the nonpolar molecular dimers (H2)2, (N2)2, and (H2)(N2)。文中比较了B3LYP加和不加DFT-D3校正时对氢气、氮气二聚体的计算结果,数据表明B3LYP根本没法得到二聚体稳定构型,或者说实际存在的构型下算得的二聚体相互作用能都是正的。而加上DFT-D3修正后,即B3LYP-D3,对这些二聚体的相互作用能计算结果则与金标准CCSD(T)起码定性一致。即便是静电主导的弱相互作用,诸如氢键、卤键,尽管传统泛函也能勉强凑合用,经过DFT-D校正后也能令计算精度显著提高。由于DFT-D同时也改进了中程的相关作用的描述,因此顺便对DFT泛函的热力学性质的计算精度也带来少许改进。目前来看可以说加入DFT-D校正有益无害,建议总加上DFT-D。
2013年华南理工大学的Qiang Peng团队000利用HF(Hartree-Fock)、B3LYP(Becke-3-Lee-Yang-Parr )、MP2 (Moller-Plesset-2) 和 QCISD (Quadratic-Configuration-Interaction with Single and Double Excitations) 结合不同的基组 6-31G、6-31+G(d)、6-311G、6-311 +G(d) 和 6-311++G(d, p),进行振动频率分析以搜索TS并确定零点能量的校正值。最后,进行过渡态结构的IRC计算,评估过渡态与反应物或产物的关系,得到反应的最小能量路径。 所有计算均使用 Gaussian 03 程序进行。论文题目为:太阳能热发电熔盐热稳定性的理论研究,发表在Applied Thermal Engineering期刊上。
2013年日本京都大学的Toshiyuki Fujii团队000基于Gaussian09,B3LYP泛函,6-311+G(d,p) 基组进行含水 Cu(II) 物质的轨道几何形状和振动频率的研究,论文题目为:与低温地球化学和生物学相关的水性化合物之间的铜同位素分馏,论文发表在Geochimica et Cosmochimica Acta期刊上。
2014年日本京都大学的Toshiyuki Fujii团队000基于Gaussian 03和B3LYP/6-311+G(d,p)泛函基组进行地球化学和生物环境相关物种中铁、镍、铜和锌同位素分馏的密度泛函理论估计,论文发表在Geochimica et Cosmochimica Acta期刊上。
2015年湖南大学的Hai-Bo Yi团队000基于Gaussian09,B3LYP泛函,Dunning的相关一致基组,已完成50%基组叠加误差 (BSSE) 校正,零点振动能(ZPE)和从0到298K的热力学校正是通过 B3LYP/aVDZ 级别的频率计算实现的。同时,使用自然键轨道(NBO)方法进行了电荷分布分析。基于密度函数理论和分子动力学研究了LiCl盐水中的高阶Cu(II)氯络合物研究。论文发表在Geochimica et Cosmochimica Acta期刊上。
2015年中国科学院大学计算地球动力学重点实验室Yongbing Li团队000基于Gaussian09,B3LYP泛函,6–31+G(d,p),LanL2DZ等基组,进行热液中镉同位素分馏的理论计算,论文发表在Chemical Geology期刊上。
2016年德国的Stefan Grimme等人000在Chemical Reviews上发表论文:Dispersion-Corrected Mean-Field Electronic Structure Methods。
2016年内蒙古工业大学的Jucai Yang团队000通过使用ABCluster全局搜索方法结合GAUSSIAN09代码进行掺镨硅簇PrSin(n = 3-9)及其阴离子的结构和性质的密度泛函研究。第一步是在B3LYP水平上实现的,Pr原子采用(ECP53MWB)基组,Si采用6-31G基组。第二步是在B3LYP水平上实现的,Pr采用SEG/ECP基组,Si原子采用cc-pVTZ基组。论文发表在Theoretical Chemistry Accounts期刊上。对应中文学位论文为密度泛函理论研究镨掺杂硅团簇的结构和性质。通过使用各种密度计算中性SmSin和YbSin(n ≤ 13)及其带电离子的平衡几何形状和性质,例如相对稳定性、磁矩、电荷转移、HOMO-LUMO 间隙和绝热电子亲和性 (AEA)泛函理论(DFT)方法。
2016年美国本尼迪克特学院的Changyong Qin团队000基于Gaussian09软件,几何形状都在 B3LYP/6-31G(d) 级别进行了优化,同时使用 MP4 和 CCSD(T) 进行了单点能量校正,进行了熔融碳酸盐中氧迁移的密度泛函理论研究,论文发表在Journal of Power Sources期刊上。
2017年Grimme团队000在Phys. Chem. Chem. Phys., 19, 32184 (2017)中列出的几个泛函的弱相互作用平均计算误差,D3用的是BJ阻尼。论文题目为:A look at the density functional theory zoo with the advanced GMTKN55 database for general main group thermochemistry, kinetics and noncovalent interactions。
2017年内蒙古工业大学的Jucai Yang团队000采用Gaussian09软件,PBE, PBE0, B3LYP, and mPW2PLYP泛函,相对论小核 (ECP28MWB)势和分段 (SEG) 价基组(表示为“SEG/ECP”)应用于 Ho 原子和cc-pVTZ 基组在几何优化期间用于Si原子,进行了掺钬硅簇 HoSin ( n = 3–9) 及其阴离子的结构和性质的密度泛函研究,论文发表在Journal of Molecular Modeling期刊上。
2017年日本京都大学的Toshiyuki Fujii团队000基于Gaussian03,6–311+G(d,p)基组(用于 H、C、O 和 Mg),使用CPCM连续溶剂化方法,进行叶绿素之间镁的理论同位素分馏研究,论文发表在scientific reports期刊上。镁在自然界具有三种天然存在的稳定同位素24 Mg、25 Mg 和26 Mg,相对丰度分别为 78.99%、10.00% 和 11.01%。
2017年昆明理工大学的Xiumin Chen团队000在基于DMol3计算了PbnAun ( n = 2-12)团簇的基态结构、平均结合能、解离能、二阶能量差、HOMO-LUMO 间隙和 平均Mulliken电荷,论文发表在RSC Advances期刊上。
2017年昆明理工大学的Bin Yang团队000使用ab initio分子动力学研究了 PbmSbn ( m + n ≤ 9) 簇的结构、稳定性和动力学。讨论了结合能的大小依赖性、簇的二阶能量差、解离能、HOMO-LUMO 间隙、Mayer 键序和 PbmSbn簇的扩散系数。论文发表在MMTA上。
2017年天津大学的周帆在其硕士学位论文《硼同位素分离过程的计算化学研究》中运用M06-2X/6-31G(d,p)的方法来计算络合反应焓变和分离因子,并创新性地将SMD溶剂化模型引入到分离因子的计算中。
2018年昆明理工大学的Xiumin Chen团队000基于DMol3进行了双金属 PbnSbn (n = 2–12) 团簇的结构、相对稳定和电子特性的密度泛函理论研究,论文发表在Journal of Cluster Science期刊上。论文对双金属团簇的基态结构、平均结合能、碎裂能、HOMO-LUMO能隙和态密度进行了理论计算。
2019年伊朗Saeedreza Emamian等人000在Journal of Computational Chemistry期刊上发表论文:“Exploring Nature and Predicting Strength of Hydrogen Bonds: A Correlation Analysis Between Atoms-in-Molecules Descriptors, Binding Energies, and Energy Components of Symmetry-Adapted Perturbation Theory”。文章利用量子化学计算和波函数分析, 充分讨论了氢键的本质,并提出了新的氢键分类和估计氢键强度的方法,文章内容非常具有普遍意义,内容丰富,值得关注。
2019年上海应用物理研究所的Jianxing Dai团队000基于Gaussian-09C1包,采用B3LYP泛函,SDD赝势(ECP60MWB)用于Th,而全电子TZVP基组用于F、Li、Na和K,进行熔融AF-ThF4体系(A+ = Li+、Na+和K+)的微观结构和宏观热物理性质的理论评估研究,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
2019年美国德克萨斯大学的Jason D. Boettger团队000基于Gaussian09评估对于在CO2(g)和H2O(g)之间同位素分馏的计算化学方法,论文发表在Journal of Chemical Information and Modeling期刊上。
2020年印度的G. Padmaja团队000在Journal of Molecular Structure发表论文:Synthesis of Sr1-xBaxBi2B2O7 glass ceramics: A study for structure and characterization using experimental techniques and DFT method。
2020年俄罗斯的Arshak A.Tsaturyan等人005基于Gaussian09、UB3LYP泛函、6-311+G(d,p)基组进行了Cu掺杂非晶硅酸盐玻璃的理论和实验表征,论文以题为Theoretical and experimental characterization of Cu-doped amorphous silicate glass发表在在Journal of Molecular Structure期刊上。
2020年印度的G. Padmaja等人000通过密度泛函理论(DFT)使用B3LYP泛函结合SDD基组进行的量子化学计算来确定Sr1-xBaxBi2B2O7(0 ≤ x ≤ 1.0)玻璃陶瓷振动特性。
2020年日本的Takuya Goto团队000基于Gaussian09包,B3LYP/6-311+G(d)泛函基组进行了用于测定氟化物熔体中氧氟化硅结构的拉曼光谱的研究,论文发表在Journal of Fluorine Chemistry期刊上。
2020年浙江理工大学的Yanying Zhao团队000基于Gaussian 09,B3LYP、BP86和M06L泛函以及6-311G*/SDD、6-311G*/Lanl2DZ 和 6-31G*/SDD
基组进行低氧化态Rh2O7+电子结构的密度泛函理论研究,论文发表在ACS Omega上。
2020年南京大学地球科学与工程系Hai-Zhen Wei团队000基于CASTEP和Gaussian进行电气石族矿物和流体平衡硼同位素分馏驱动机制的密度泛函理论研究,论文发表在Chemical Geology期刊上。
2020年重庆大学的Min Tan等人000基于Gaussian进行熔融 NaF-AlF3 盐的光谱性质和离子组成的量子化学预测,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
2021年中南大学的FansongLiu等人000基于能量和键和特征分析研究As-S团簇结构-稳定性之间的关系;论文使用使用了B3LYP泛函和def2SVP进行优化和振动频率计算;用def2TZVP基组来进行单点能计算。键合特征包括:Hirshfeld电荷、平均键长、Mayer键序;能量分析包括形成能、平均结合能、碎裂能、二阶能量差。为了解释形成能差异,从团簇电子结构信息和分子轨道组成来解释电子能级的稳定性,相关参数包括:AIM理论中的ELF及其平面投影图,分波态密度(PDOS)图和相应的原子轨道组成分析。论文发表在Journal of Hazardous Materials期刊上。
2021年上海应用物理研究所的Chenyang Wang团队000基于Gaussian09软件,B3LYP泛函,6–311+G(d)和SDD基组进行了熔融FLiNaK中氟化镥和氟氧化物结构的拉曼和密度泛函理论研究,论文发表在Spectrochimica Acta Part A: Molecular and Biomolecular Spectroscopy期刊上。
2021年上海应用物理研究所的Chenyang Wang团队000基于Gaussian09软件,B3LYP泛函,6–311+G(d)和SDD基组进行了熔融 FLiNaK 中 钽(V)氟和氧氟配合物结构的拉曼光谱和理论研究,论文发表在Journal of Molecular Liquids。
2021年上海应用物理研究所的Chenyang Wang团队000基于Gaussian09软件,B3LYP泛函,6–311+G(d),def2-TZVPP 和 def2-QZVPP 基组进行了熔融 FLiBe 和 FLiNaK 中氟化钍和氧氟化物阴离子的结构研究,论文发表在JPCB上。
2021年重庆大学的Bo Shang团队000基于Gaussian09软件,在B3LYP/6-311G(d)水平上进行了熔融 NaF-AlF3盐的光谱性质和离子组成的量子化学预测研究,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
2021年重庆大学的Tao Li团队000在基于Gaussian09软件,在B3LYP/6-311G(d)水平上进行了铝电解石墨阴极形成的碳化铝溶解的研究,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
2021年东北大学的Xianwei Hu团队000基于Gaussian09软件,B3LYP/6-311G*泛函和基组
进行了KF-AlF3-Al2O3体系中配合物的拉曼光谱和量子理论计算,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
2021年北京科音卢天等人000发表针对“sp-杂化的18碳环(C18)键和光谱理论研究”评论文章,指出了其中的大量错误,论文发表在Journal of Molecular Modeling。
2021年南京大学Hai-Zhen Wei团队006基于Gaussian16软件包、B3LYP泛函、6-31G(d) 基组进行硼配位和B/Si 排序控制矿物、熔体和流体之间的平衡硼同位素分馏的研究,论文发表在Chemical Geology期刊上。
2021年重庆大学的Min Tan等人000基于Gaussian进行了铝电解石墨阴极形成的碳化铝溶解的研究,论文发表在Journal of Molecular Liquids期刊上。
重要论文
2001年美国斯坦福大学的Sung Keun Lee团队007基于量子化学计算和17O 和11B NMR研究硼硅酸盐玻璃的拓扑无序和反应性,[4]Si-O-[3]B ([4]Si-O-[4]Si, [4]Si-O-[3]B,和[3]B−O−[3]B) 的稳定性是根据桥接氧簇之间的相对能量差异来评估的在B3LYP/6-311+G(2d,p)//HF/3-21G 和 B3LYP/6-311+G(2d,p) 理论水平计算,论文发表在JPCB上。
(As2S2)n、(As2S3)n和(As2S5)n (n=1–)簇的初始配置搜索基于两个步骤。首先,通过ABCluster 2.0全局搜索技术结合GFN1-xTB,(As2S2)n、(As2S3)n和(As2S5)n (n=1–)的5000多个异构体结构。其次,前三个最小结构通过B3LYP泛函和全电子小基组(def2SVP)进行优化。在同一水平上进行振动频率计算,以检查其他势能表面上的局部极小结构。 同时,在几何优化过程中充分考虑了自旋多重性。 完成初始构型搜索工作后,我们选择具有全电子def2TZVP基组的B3LYP泛函来细化单点能量计算。评估隐式溶剂模型以校正所有过程中由溶剂效应引起的势能面和全电子特性。第三,利用Multiwfn 3.5进行包括结构参数在内的波函数分析,实现轨道信息和电子特性,计算拉曼光谱。为了验证优化方法的准确性,我们采用了不同的泛函和基本集合(例如,As2二聚体和S2二聚体的理论结合能、键长和振动频率),并将结果与实测实验数据进行了比较。当我们选择 As16S16簇、As16S24簇和 As16S40簇的等值面值为0.7时,计算了电子定位函数 (ELF) 。
Binding geometries of silicate species on ferrihydrite surfaces
Molecular dynamics investigation of Halide-containing Phospho-silicate bioactive glasses
Adsorption and subsequent reaction of a water molecule on silicate and silica cluster anions
Alkali carbonates promote CO 2 capture by sodium orthosilicate
Hydrolysis mechanism of double six–membered ring pentaborate anion
Mechanism of K+, Cs+ ion exchange in nickel ferrocyanide: a density functional theory study
Structure and properties of gallium-rich sodium germano-gallate glasses
Stability of mixed-oxide titanosilicates: dependency on size and composition from nanocluster to bulk
Quantum chemical calculation of molecular structures of Al 2 Fe 2 and Al 2 FeCo tetranuclear metalloclusters
Silica Activity Measurements in the Y2O3–SiO2 System and Applications to Modeling of Coating Volatility
From silicates to oxonitridosilicates: improving optical anisotropy for phase-matching as ultraviolet nonlinear optical materials
Investigation on structure and luminescence properties of Yb3+-doped silica materials
Role of Coordination Number, Geometry, and Local Disorder on 27Al NMR Chemical Shifts and Quadrupolar Coupling Constants: Case Study with Aluminosilicates
Intense d-p Hybridization Induced a Vast SHG Response Disparity between Tetrahedral Vanadates and Arsenates
Molecular dynamics simulation and electrical conductivity measurement of Na2O• 3SiO2 melt under high pressure; relationship between its structure and properties
Gibbsite (100) and kaolinite (100) sorption of cadmium (II): A density functional theory and XANES study of structures and energies
Mechanism of the initial stage of silicate oligomerization
A general protocol for determining the structures of molecularly ordered but noncrystalline silicate frameworks
Nature of chemical and topological disorder in borogermanate glasses: Insights from B-11 and O-17 solid-State NMR and quantum chemical calculations
Structural properties of iron-phosphate glasses: spectroscopic studies and ab initio simulations
Modeling, structural, and spectroscopic studies of cobalt-doped lithium phosphate glasses and effect of gamma irradiation
Electronic and Vibrational Properties of Stable Isomers of (SiO)n(0,±) (n = 2–7) Clusters
Computation of charge distribution and electrostatic potential in silicates with the use of chemical potential equalization models
Energetics and bonding in aluminosilicate rings with alkali metal and alkaline-earth metal charge-compensating cations
Structural disorder and the effects of aging in a phosphate glass: Results from two-dimensional 31P PASS NMR spectroscopy
Mass spectrometric study of thermodynamic properties of BaO-CeO2. The formation enthalpy of BaCeO3 (solid)
Structural and theoretical study of strontium borophosphate glasses using raman spectroscopy and ab initio molecular orbital method
Mercury Sulfide Dimorphism in Thioarsenate Glasses
高被引论文
1970年,BSSE基组重叠误差校正:The calculation of small molecular interactions by the differences of separate total energies. Some procedures with reduced errors
1980年,6-311+G(d,p)基组加极化函数:Self-consistent molecular-orbital methods .20. basis set for correlated wave-functions
1993年,B3LYP泛函:A new mixing of Hartree–Fock and local density‐functional theories
1994年,def2SVP基组:Ab Initio Calculation of Vibrational Absorption and Circular Dichroism Spectra Using Density Functional Force Fields
2005年,def2系列基组,Reinhart Ahlrichs:Balanced basis sets of split valence, triple zeta valence and quadruple zeta valence quality for H to Rn: Design and assessment of accuracy
2008年,wB97XD,Systematic optimization of long-range corrected hybrid density functionals
2010年,DFT-D3色散校正,A consistent and accurate ab initio parametrization of density functional dispersion correction (DFT-D) for the 94 elements H-Pu
2010年,带D后缀的def2系列,Property-optimized Gaussian basis sets for molecular response calculations 作者提出def2-SVPD、TZVPD、TZVPPD、QZVPD、QZVPPD,分别是对def2-SVP、TZVP、TZVPP、QZVP、QZVPP加上弥散函数,弥散函数的指数是通过优化原子的HF极化率得到(同样适合DFT下极化率计算)。这些基组用于其它需要弥散函数的任务,比如算弱相互作用,预期也能起到不错效果,但未必比本文其它的加弥散方式做法更好。
量子化学计算小常识
1 |
|
原则上说,DFT-D3可以与任何交换相关泛函相结合。甚至对于弱相互作用描述已经很不错的双杂化泛函、M06-2X,加上DFT-D3后性能也能得到稍微的改进。但是也有一些出名的泛函本身就标配了特定形式的色散修正项,比如B97D、ωB97XD和B2PLYPD,在泛函定义的时候就专门给它们标配了DFT-D2形式的校正,显然就不能再给它们加上DFT-D3修正了。泛函结合DFT-D3校正后通常用“泛函名”+“-D3”来称呼,例如BLYP结合DFT-D3就叫BLYP-D3。
参考文献